Pravilno skladištenje crnog luka ključno je za produženje njegove svežine i smanjenje gubitaka. Zato je bitno da parametri u prostoru za čuvanje, poput temperature i relativne vlažnosti vazduha, budu optimalni. Redovni pregledi su takođe važni kako bi se pravovremeno uočilo truljenje ili oštećenje uskladištenih glavica.